Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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GPS1Q13098 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GPS1Q13098 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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