Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NFX1Q12986 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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