Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TROQ12816 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TROQ12816 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TROQ12816 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TROQ12816 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TROQ12816 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TROQ12816 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TROQ12816 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TROQ12816 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
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