Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGEF5Q12774 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF5Q12774 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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