Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms