Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms