Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOP2BQ02880 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms