Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BNC1Q01954 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms