Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2F1Q01094 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms