Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTBN1Q01082 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms