Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1BQ00975 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms