Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXC5Q00444 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms