Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HERVK_113P62684 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P62684 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms