Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A2P55011 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms