Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA4P52798 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms