Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMARCA4P51532 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms