Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NESP48681 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NESP48681 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NESP48681 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NESP48681 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NESP48681 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NESP48681 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NESP48681 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NESP48681 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms