Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms