Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNB4P30926 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms