Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5AP29375 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5AP29375 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms