Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMBRP28336 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMBRP28336 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NMBRP28336 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms