Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXP28300 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXP28300 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXP28300 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXP28300 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXP28300 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXP28300 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms