Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms