Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB4P16144 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB4P16144 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms