Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD46P15529 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD46P15529 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD46P15529 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms