Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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