Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLK3P07288 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLK3P07288 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KLK3P07288 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms