Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSF2P04141 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSF2P04141 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSF2P04141 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSF2P04141 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSF2P04141 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms