Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HLA-DQB1P01920 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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