Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYNGR3O43761 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms