Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms