Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFSF14O43557 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF14O43557 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF14O43557 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF14O43557 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFSF14O43557 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms