Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNPHO15079 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNPHO15079 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms