Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms