Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD3A6NKT7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD3A6NKT7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms