Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms