Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms