Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms