Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF346Q9UL40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms