Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHIC2Q9UKJ5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms