Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN11AQ9UI33 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms