Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IFT172Q9UG01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms