Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms