Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS29Q9UBQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms