Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms