Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms