Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOMER3Q9NSC5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms