Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms