Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KIAA1549Q9HCM3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms