Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms